والإملاء والإنشاء والرياضيات وحفظ القرآن والأدعية المأثورة وأحاديث أخلاقية . وتستمر 3 سنوات . 2 - مرحلة المتون الأولية : وتشمل المعاني والبيان والبديع والمعالم واللمعة وشرح الباب الحادي عشر والتاريخ . وتستمر 3 سنوات . 3 - مرحلة المتون العالية : وتشمل الرسائل والمكاسب والكفاية والتفسير وشرح التجريد والأديان والمذاهب . وتستمر 5 سنوات . 4 - مرحلة التخصص في الفقه والأصول ( وتسمى بمدرسة الإمام الصادق عليه السلام المنهج الخاص ) ودورتها 4 سنوات . 5 - مرحلة التخصص في العلوم الإسلامية كالتفسير والخطابة والتاريخ والجدل والكلام والأديان والمذاهب والفلسفة واللغة الأجنبية والمعلومات العامة وعلم الحديث والاحتجاجات ( وتسمى بالمدرسة الحسينية العالية ) ودورتها 4 سنوات . ان النظام الذي يجري في هذه المدارس دقيق جدا ، حيث سجلات الحضور والغياب للطلاب ، والامتحانات الشهرية ، والامتحانات الفصلية والنهائية . وكان من دأبه رحمة اللَّه عليه الإلحاح على تشجيع الفضلاء والمجدين ، وحثّهم على التفرّغ للدراسة ، ولذلك فان رواتب الطلاب كانت تتصاعد حسب رقى مرتبتهم الدراسية . كما كانت توزع الجوائز على الطلاب المتفوقين كل سنة . كان عدد الطلاب الملتزمين مع هذه المناهج حوالي 650 طالبا كلَّهم من عيون الفضلاء والمحصلين على اختلاف مراتبهم . ولو قيست هذه النسبة مع عدد المنتمين إلى الحوزة العلمية من أساتذة وعلماء وأئمة جماعة وخطباء